Protein–RNA interactions for Protein: Q08999

RBL2, Retinoblastoma-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL2Q08999 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBL2Q08999 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms