Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms