Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSME1Q06323 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PSME1Q06323 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms