Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms