Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC18A2Q05940 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms