Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APBA1Q02410 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APBA1Q02410 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms