Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEX3Q00994 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms