Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MAT1AQ00266 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MAT1AQ00266 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms