Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMAD3P84022 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms