Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRB1P82279 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRB1P82279 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRB1P82279 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CRB1P82279 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRB1P82279 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRB1P82279 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRB1P82279 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRB1P82279 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRB1P82279 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRB1P82279 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRB1P82279 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRB1P82279 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRB1P82279 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRB1P82279 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRB1P82279 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRB1P82279 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRB1P82279 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRB1P82279 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRB1P82279 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRB1P82279 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRB1P82279 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRB1P82279 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRB1P82279 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRB1P82279 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CRB1P82279 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRB1P82279 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRB1P82279 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRB1P82279 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRB1P82279 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRB1P82279 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRB1P82279 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRB1P82279 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRB1P82279 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRB1P82279 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRB1P82279 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRB1P82279 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CRB1P82279 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRB1P82279 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CRB1P82279 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRB1P82279 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRB1P82279 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRB1P82279 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRB1P82279 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRB1P82279 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRB1P82279 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRB1P82279 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRB1P82279 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRB1P82279 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CRB1P82279 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CRB1P82279 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CRB1P82279 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CRB1P82279 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CRB1P82279 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CRB1P82279 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRB1P82279 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRB1P82279 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRB1P82279 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRB1P82279 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRB1P82279 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRB1P82279 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRB1P82279 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRB1P82279 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRB1P82279 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRB1P82279 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CRB1P82279 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRB1P82279 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRB1P82279 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRB1P82279 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRB1P82279 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRB1P82279 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRB1P82279 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRB1P82279 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRB1P82279 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRB1P82279 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRB1P82279 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRB1P82279 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRB1P82279 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRB1P82279 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRB1P82279 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRB1P82279 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRB1P82279 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRB1P82279 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRB1P82279 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRB1P82279 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRB1P82279 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRB1P82279 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRB1P82279 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRB1P82279 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CRB1P82279 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRB1P82279 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRB1P82279 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRB1P82279 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRB1P82279 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRB1P82279 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRB1P82279 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRB1P82279 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRB1P82279 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRB1P82279 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRB1P82279 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms