Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX3P78415 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX3P78415 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX3P78415 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX3P78415 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX3P78415 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX3P78415 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX3P78415 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX3P78415 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX3P78415 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX3P78415 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX3P78415 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX3P78415 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX3P78415 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX3P78415 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX3P78415 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX3P78415 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX3P78415 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX3P78415 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX3P78415 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX3P78415 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX3P78415 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX3P78415 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX3P78415 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX3P78415 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX3P78415 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX3P78415 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX3P78415 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX3P78415 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX3P78415 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX3P78415 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX3P78415 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX3P78415 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX3P78415 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX3P78415 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX3P78415 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX3P78415 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX3P78415 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX3P78415 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRX3P78415 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRX3P78415 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRX3P78415 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRX3P78415 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRX3P78415 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRX3P78415 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
IRX3P78415 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRX3P78415 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
IRX3P78415 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRX3P78415 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRX3P78415 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRX3P78415 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRX3P78415 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRX3P78415 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX3P78415 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX3P78415 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX3P78415 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX3P78415 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX3P78415 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX3P78415 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX3P78415 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX3P78415 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX3P78415 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX3P78415 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX3P78415 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX3P78415 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX3P78415 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX3P78415 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX3P78415 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX3P78415 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX3P78415 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX3P78415 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX3P78415 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX3P78415 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX3P78415 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX3P78415 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX3P78415 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX3P78415 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX3P78415 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX3P78415 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX3P78415 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX3P78415 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX3P78415 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX3P78415 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX3P78415 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX3P78415 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX3P78415 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX3P78415 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX3P78415 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX3P78415 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX3P78415 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX3P78415 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX3P78415 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX3P78415 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX3P78415 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX3P78415 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX3P78415 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX3P78415 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX3P78415 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX3P78415 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX3P78415 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms