Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX5P78411 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX5P78411 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX5P78411 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX5P78411 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX5P78411 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX5P78411 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX5P78411 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX5P78411 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX5P78411 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX5P78411 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX5P78411 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX5P78411 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX5P78411 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX5P78411 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX5P78411 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX5P78411 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX5P78411 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX5P78411 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX5P78411 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX5P78411 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX5P78411 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX5P78411 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX5P78411 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX5P78411 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX5P78411 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX5P78411 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX5P78411 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX5P78411 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX5P78411 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX5P78411 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX5P78411 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX5P78411 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX5P78411 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX5P78411 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX5P78411 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX5P78411 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX5P78411 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX5P78411 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX5P78411 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX5P78411 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRX5P78411 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX5P78411 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX5P78411 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX5P78411 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX5P78411 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX5P78411 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX5P78411 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX5P78411 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX5P78411 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX5P78411 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX5P78411 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX5P78411 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX5P78411 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX5P78411 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX5P78411 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX5P78411 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX5P78411 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX5P78411 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX5P78411 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX5P78411 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX5P78411 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX5P78411 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX5P78411 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX5P78411 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX5P78411 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX5P78411 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX5P78411 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX5P78411 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX5P78411 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
IRX5P78411 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
IRX5P78411 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX5P78411 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX5P78411 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX5P78411 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX5P78411 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX5P78411 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX5P78411 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX5P78411 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX5P78411 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX5P78411 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX5P78411 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX5P78411 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX5P78411 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX5P78411 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX5P78411 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX5P78411 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX5P78411 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX5P78411 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX5P78411 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX5P78411 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX5P78411 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX5P78411 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX5P78411 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX5P78411 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX5P78411 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX5P78411 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX5P78411 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX5P78411 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX5P78411 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms