Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNTNAP1P78357 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP1P78357 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP1P78357 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP1P78357 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP1P78357 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP1P78357 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP1P78357 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP1P78357 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP1P78357 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP1P78357 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP1P78357 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP1P78357 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTNAP1P78357 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTNAP1P78357 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTNAP1P78357 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTNAP1P78357 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTNAP1P78357 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTNAP1P78357 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTNAP1P78357 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTNAP1P78357 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms