Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOMO3P69849 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NOMO3P69849 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms