Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GNB1P62873 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GNB1P62873 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GNB1P62873 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GNB1P62873 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GNB1P62873 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GNB1P62873 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GNB1P62873 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GNB1P62873 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GNB1P62873 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GNB1P62873 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GNB1P62873 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GNB1P62873 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GNB1P62873 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GNB1P62873 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GNB1P62873 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GNB1P62873 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB1P62873 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB1P62873 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB1P62873 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB1P62873 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB1P62873 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB1P62873 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB1P62873 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB1P62873 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB1P62873 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB1P62873 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB1P62873 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB1P62873 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB1P62873 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB1P62873 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB1P62873 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB1P62873 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB1P62873 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB1P62873 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB1P62873 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB1P62873 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB1P62873 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB1P62873 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB1P62873 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB1P62873 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB1P62873 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB1P62873 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB1P62873 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB1P62873 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB1P62873 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB1P62873 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB1P62873 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB1P62873 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB1P62873 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB1P62873 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB1P62873 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB1P62873 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB1P62873 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB1P62873 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB1P62873 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB1P62873 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB1P62873 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB1P62873 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB1P62873 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB1P62873 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB1P62873 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB1P62873 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB1P62873 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB1P62873 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB1P62873 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB1P62873 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB1P62873 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB1P62873 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB1P62873 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB1P62873 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB1P62873 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB1P62873 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB1P62873 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB1P62873 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB1P62873 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB1P62873 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB1P62873 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB1P62873 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB1P62873 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB1P62873 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB1P62873 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB1P62873 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB1P62873 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB1P62873 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB1P62873 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB1P62873 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB1P62873 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB1P62873 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB1P62873 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB1P62873 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB1P62873 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB1P62873 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB1P62873 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB1P62873 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB1P62873 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB1P62873 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB1P62873 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB1P62873 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB1P62873 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms