Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2HP62256 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms