Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK11-1P61568 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms