Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms