Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms