Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRP6P59044 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP6P59044 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms