Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM3BP58499 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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FAM3BP58499 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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FAM3BP58499 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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FAM3BP58499 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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