Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA9P57773 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA9P57773 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA9P57773 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA9P57773 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA9P57773 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA9P57773 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA9P57773 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA9P57773 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA9P57773 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA9P57773 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA9P57773 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA9P57773 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA9P57773 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA9P57773 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA9P57773 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA9P57773 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA9P57773 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA9P57773 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA9P57773 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA9P57773 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA9P57773 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA9P57773 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA9P57773 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA9P57773 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA9P57773 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA9P57773 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA9P57773 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA9P57773 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA9P57773 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA9P57773 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA9P57773 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA9P57773 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA9P57773 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA9P57773 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA9P57773 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA9P57773 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA9P57773 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA9P57773 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA9P57773 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA9P57773 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA9P57773 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA9P57773 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA9P57773 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA9P57773 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA9P57773 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA9P57773 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA9P57773 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA9P57773 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA9P57773 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA9P57773 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA9P57773 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA9P57773 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA9P57773 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA9P57773 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA9P57773 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA9P57773 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA9P57773 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA9P57773 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA9P57773 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA9P57773 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA9P57773 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA9P57773 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA9P57773 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA9P57773 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA9P57773 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA9P57773 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA9P57773 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA9P57773 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA9P57773 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA9P57773 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA9P57773 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA9P57773 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA9P57773 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA9P57773 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA9P57773 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA9P57773 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA9P57773 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GJA9P57773 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA9P57773 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA9P57773 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA9P57773 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA9P57773 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA9P57773 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA9P57773 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA9P57773 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA9P57773 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA9P57773 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA9P57773 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA9P57773 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA9P57773 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA9P57773 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA9P57773 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA9P57773 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA9P57773 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA9P57773 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA9P57773 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA9P57773 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA9P57773 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA9P57773 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms