Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIK1P57059 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIK1P57059 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIK1P57059 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIK1P57059 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIK1P57059 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIK1P57059 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIK1P57059 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIK1P57059 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIK1P57059 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIK1P57059 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIK1P57059 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIK1P57059 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIK1P57059 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIK1P57059 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIK1P57059 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIK1P57059 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIK1P57059 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIK1P57059 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIK1P57059 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIK1P57059 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIK1P57059 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIK1P57059 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIK1P57059 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIK1P57059 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIK1P57059 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIK1P57059 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIK1P57059 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIK1P57059 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIK1P57059 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIK1P57059 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIK1P57059 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIK1P57059 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIK1P57059 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIK1P57059 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIK1P57059 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SIK1P57059 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SIK1P57059 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SIK1P57059 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIK1P57059 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIK1P57059 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SIK1P57059 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SIK1P57059 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SIK1P57059 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SIK1P57059 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SIK1P57059 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SIK1P57059 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SIK1P57059 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIK1P57059 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIK1P57059 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIK1P57059 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIK1P57059 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIK1P57059 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIK1P57059 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIK1P57059 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SIK1P57059 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIK1P57059 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIK1P57059 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIK1P57059 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIK1P57059 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIK1P57059 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIK1P57059 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIK1P57059 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIK1P57059 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIK1P57059 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SIK1P57059 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIK1P57059 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIK1P57059 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIK1P57059 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIK1P57059 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIK1P57059 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIK1P57059 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIK1P57059 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SIK1P57059 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIK1P57059 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIK1P57059 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIK1P57059 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIK1P57059 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIK1P57059 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIK1P57059 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIK1P57059 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIK1P57059 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIK1P57059 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIK1P57059 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIK1P57059 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIK1P57059 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SIK1P57059 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIK1P57059 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIK1P57059 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIK1P57059 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIK1P57059 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SIK1P57059 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIK1P57059 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIK1P57059 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SIK1P57059 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIK1P57059 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIK1P57059 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIK1P57059 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIK1P57059 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIK1P57059 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms