Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELLP55199 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELLP55199 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELLP55199 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELLP55199 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELLP55199 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELLP55199 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELLP55199 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELLP55199 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELLP55199 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELLP55199 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELLP55199 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELLP55199 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELLP55199 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELLP55199 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELLP55199 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELLP55199 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELLP55199 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELLP55199 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELLP55199 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ELLP55199 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELLP55199 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELLP55199 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELLP55199 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELLP55199 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELLP55199 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELLP55199 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELLP55199 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELLP55199 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELLP55199 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELLP55199 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELLP55199 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELLP55199 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELLP55199 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ELLP55199 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELLP55199 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELLP55199 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELLP55199 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELLP55199 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELLP55199 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELLP55199 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELLP55199 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELLP55199 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELLP55199 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELLP55199 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELLP55199 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELLP55199 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELLP55199 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ELLP55199 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ELLP55199 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ELLP55199 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ELLP55199 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ELLP55199 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ELLP55199 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELLP55199 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELLP55199 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELLP55199 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELLP55199 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELLP55199 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELLP55199 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELLP55199 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELLP55199 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELLP55199 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELLP55199 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELLP55199 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELLP55199 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELLP55199 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELLP55199 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ELLP55199 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELLP55199 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELLP55199 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELLP55199 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELLP55199 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELLP55199 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELLP55199 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELLP55199 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELLP55199 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELLP55199 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELLP55199 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELLP55199 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELLP55199 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELLP55199 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELLP55199 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELLP55199 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ELLP55199 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELLP55199 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELLP55199 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELLP55199 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELLP55199 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELLP55199 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELLP55199 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELLP55199 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELLP55199 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELLP55199 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELLP55199 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELLP55199 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELLP55199 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELLP55199 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELLP55199 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELLP55199 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms