Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GBX2P52951 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GBX2P52951 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GBX2P52951 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GBX2P52951 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GBX2P52951 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX2P52951 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX2P52951 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX2P52951 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX2P52951 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX2P52951 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX2P52951 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX2P52951 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX2P52951 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX2P52951 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX2P52951 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX2P52951 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX2P52951 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX2P52951 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX2P52951 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX2P52951 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX2P52951 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX2P52951 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX2P52951 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX2P52951 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBX2P52951 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBX2P52951 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBX2P52951 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBX2P52951 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBX2P52951 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBX2P52951 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBX2P52951 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBX2P52951 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBX2P52951 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBX2P52951 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GBX2P52951 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBX2P52951 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBX2P52951 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBX2P52951 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBX2P52951 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBX2P52951 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBX2P52951 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GBX2P52951 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBX2P52951 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBX2P52951 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBX2P52951 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBX2P52951 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBX2P52951 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBX2P52951 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBX2P52951 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBX2P52951 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBX2P52951 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBX2P52951 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBX2P52951 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBX2P52951 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBX2P52951 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBX2P52951 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBX2P52951 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBX2P52951 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBX2P52951 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GBX2P52951 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBX2P52951 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBX2P52951 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBX2P52951 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBX2P52951 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBX2P52951 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBX2P52951 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBX2P52951 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBX2P52951 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBX2P52951 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBX2P52951 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBX2P52951 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBX2P52951 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBX2P52951 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX2P52951 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX2P52951 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX2P52951 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX2P52951 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX2P52951 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX2P52951 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX2P52951 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX2P52951 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX2P52951 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX2P52951 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX2P52951 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX2P52951 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX2P52951 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX2P52951 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX2P52951 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX2P52951 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX2P52951 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX2P52951 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX2P52951 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX2P52951 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX2P52951 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX2P52951 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX2P52951 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX2P52951 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX2P52951 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX2P52951 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms