Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
EFNA4P52798 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms