Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK4P51957 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK4P51957 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK4P51957 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK4P51957 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK4P51957 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK4P51957 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK4P51957 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK4P51957 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK4P51957 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK4P51957 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK4P51957 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK4P51957 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK4P51957 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK4P51957 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK4P51957 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK4P51957 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK4P51957 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK4P51957 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK4P51957 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK4P51957 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK4P51957 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK4P51957 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK4P51957 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK4P51957 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK4P51957 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK4P51957 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK4P51957 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK4P51957 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK4P51957 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK4P51957 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK4P51957 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK4P51957 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK4P51957 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK4P51957 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK4P51957 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK4P51957 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK4P51957 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK4P51957 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK4P51957 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK4P51957 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK4P51957 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK4P51957 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK4P51957 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK4P51957 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK4P51957 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK4P51957 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK4P51957 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK4P51957 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK4P51957 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK4P51957 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK4P51957 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK4P51957 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK4P51957 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK4P51957 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK4P51957 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK4P51957 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK4P51957 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK4P51957 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK4P51957 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK4P51957 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK4P51957 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK4P51957 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK4P51957 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK4P51957 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK4P51957 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK4P51957 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK4P51957 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK4P51957 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK4P51957 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK4P51957 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK4P51957 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEK4P51957 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEK4P51957 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEK4P51957 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEK4P51957 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEK4P51957 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEK4P51957 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEK4P51957 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEK4P51957 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEK4P51957 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEK4P51957 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEK4P51957 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEK4P51957 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEK4P51957 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEK4P51957 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEK4P51957 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEK4P51957 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEK4P51957 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEK4P51957 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEK4P51957 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEK4P51957 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEK4P51957 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEK4P51957 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NEK4P51957 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEK4P51957 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEK4P51957 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEK4P51957 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEK4P51957 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK4P51957 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms