Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBP50607 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBP50607 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBP50607 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBP50607 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBP50607 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBP50607 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBP50607 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBP50607 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBP50607 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBP50607 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBP50607 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBP50607 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBP50607 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBP50607 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBP50607 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBP50607 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBP50607 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBP50607 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBP50607 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBP50607 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBP50607 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBP50607 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBP50607 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBP50607 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBP50607 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBP50607 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBP50607 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBP50607 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBP50607 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBP50607 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBP50607 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBP50607 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBP50607 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBP50607 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBP50607 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBP50607 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBP50607 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBP50607 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBP50607 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBP50607 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBP50607 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBP50607 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBP50607 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBP50607 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBP50607 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBP50607 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBP50607 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBP50607 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBP50607 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBP50607 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBP50607 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBP50607 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBP50607 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBP50607 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBP50607 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBP50607 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBP50607 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TUBP50607 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TUBP50607 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TUBP50607 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBP50607 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBP50607 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBP50607 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBP50607 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBP50607 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBP50607 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBP50607 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBP50607 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBP50607 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBP50607 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBP50607 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBP50607 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBP50607 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBP50607 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBP50607 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBP50607 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBP50607 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBP50607 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBP50607 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBP50607 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBP50607 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBP50607 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBP50607 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBP50607 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBP50607 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBP50607 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBP50607 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBP50607 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBP50607 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBP50607 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBP50607 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBP50607 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBP50607 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBP50607 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBP50607 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBP50607 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBP50607 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBP50607 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBP50607 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms