Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRIP1P50238 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms