Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRIM1P49642 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms