Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK8P49336 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK8P49336 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK8P49336 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK8P49336 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK8P49336 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK8P49336 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK8P49336 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK8P49336 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK8P49336 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK8P49336 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK8P49336 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK8P49336 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK8P49336 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK8P49336 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK8P49336 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK8P49336 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK8P49336 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK8P49336 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK8P49336 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK8P49336 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK8P49336 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK8P49336 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK8P49336 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK8P49336 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK8P49336 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK8P49336 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK8P49336 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK8P49336 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK8P49336 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK8P49336 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK8P49336 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK8P49336 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK8P49336 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK8P49336 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK8P49336 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK8P49336 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK8P49336 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK8P49336 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK8P49336 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK8P49336 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK8P49336 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK8P49336 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK8P49336 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK8P49336 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK8P49336 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK8P49336 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK8P49336 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK8P49336 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK8P49336 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK8P49336 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK8P49336 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK8P49336 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK8P49336 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK8P49336 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK8P49336 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK8P49336 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK8P49336 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK8P49336 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK8P49336 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK8P49336 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK8P49336 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK8P49336 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK8P49336 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK8P49336 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK8P49336 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK8P49336 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK8P49336 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK8P49336 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK8P49336 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK8P49336 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK8P49336 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK8P49336 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK8P49336 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK8P49336 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK8P49336 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK8P49336 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK8P49336 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK8P49336 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK8P49336 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK8P49336 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK8P49336 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK8P49336 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK8P49336 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK8P49336 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK8P49336 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK8P49336 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK8P49336 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK8P49336 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK8P49336 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK8P49336 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK8P49336 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK8P49336 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK8P49336 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK8P49336 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK8P49336 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK8P49336 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK8P49336 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK8P49336 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK8P49336 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms