Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NESP48681 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NESP48681 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
NESP48681 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
NESP48681 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
NESP48681 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
NESP48681 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NESP48681 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NESP48681 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NESP48681 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NESP48681 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NESP48681 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NESP48681 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NESP48681 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
NESP48681 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NESP48681 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NESP48681 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
NESP48681 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
NESP48681 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
NESP48681 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
NESP48681 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
NESP48681 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
NESP48681 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
NESP48681 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
NESP48681 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
NESP48681 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NESP48681 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NESP48681 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
NESP48681 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NESP48681 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
NESP48681 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NESP48681 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NESP48681 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
NESP48681 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
NESP48681 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
NESP48681 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
NESP48681 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NESP48681 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
NESP48681 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
NESP48681 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
NESP48681 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
NESP48681 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
NESP48681 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
NESP48681 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
NESP48681 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
NESP48681 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
NESP48681 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
NESP48681 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
NESP48681 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
NESP48681 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
NESP48681 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
NESP48681 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.3
NESP48681 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NESP48681 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NESP48681 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
NESP48681 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
NESP48681 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
NESP48681 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
NESP48681 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
NESP48681 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NESP48681 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
NESP48681 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
NESP48681 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NESP48681 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NESP48681 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NESP48681 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC35.61■■■■□ 3.29
NESP48681 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC35.61■■■■□ 3.29
NESP48681 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC35.61■■■■□ 3.29
NESP48681 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
NESP48681 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
NESP48681 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
NESP48681 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
NESP48681 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NESP48681 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NESP48681 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NESP48681 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
NESP48681 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
NESP48681 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
NESP48681 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
NESP48681 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NESP48681 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NESP48681 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NESP48681 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NESP48681 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NESP48681 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NESP48681 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NESP48681 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NESP48681 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
NESP48681 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
NESP48681 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
NESP48681 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NESP48681 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
NESP48681 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
NESP48681 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
NESP48681 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
NESP48681 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
NESP48681 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
NESP48681 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
NESP48681 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
NESP48681 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms