Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA8P48165 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA8P48165 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA8P48165 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJA8P48165 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJA8P48165 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJA8P48165 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJA8P48165 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJA8P48165 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJA8P48165 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJA8P48165 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJA8P48165 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GJA8P48165 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJA8P48165 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJA8P48165 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJA8P48165 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJA8P48165 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GJA8P48165 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GJA8P48165 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GJA8P48165 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA8P48165 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA8P48165 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA8P48165 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA8P48165 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA8P48165 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA8P48165 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA8P48165 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA8P48165 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA8P48165 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA8P48165 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA8P48165 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA8P48165 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA8P48165 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA8P48165 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA8P48165 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA8P48165 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA8P48165 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA8P48165 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA8P48165 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA8P48165 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA8P48165 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA8P48165 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA8P48165 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA8P48165 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA8P48165 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA8P48165 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA8P48165 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA8P48165 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA8P48165 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA8P48165 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA8P48165 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA8P48165 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA8P48165 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA8P48165 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA8P48165 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA8P48165 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA8P48165 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA8P48165 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA8P48165 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA8P48165 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA8P48165 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA8P48165 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA8P48165 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA8P48165 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA8P48165 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA8P48165 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA8P48165 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA8P48165 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA8P48165 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA8P48165 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA8P48165 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA8P48165 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA8P48165 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA8P48165 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA8P48165 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA8P48165 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA8P48165 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA8P48165 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA8P48165 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA8P48165 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA8P48165 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA8P48165 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA8P48165 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA8P48165 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA8P48165 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA8P48165 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA8P48165 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA8P48165 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA8P48165 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA8P48165 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA8P48165 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA8P48165 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA8P48165 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA8P48165 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA8P48165 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA8P48165 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA8P48165 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA8P48165 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA8P48165 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA8P48165 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms