Protein–RNA interactions for Protein: P43607

RRT5, Regulator of rDNA transcription protein 5, yeastyeast

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRT5P43607 CMS1YLR003C 876 nt2.29□□□□□ -2.04
RRT5P43607 SIP18YMR175W 240 nt2.29□□□□□ -2.04
RRT5P43607 RPB11YOL005C 363 nt2.29□□□□□ -2.04
RRT5P43607 CDC33YOL139C 642 nt2.29□□□□□ -2.04
RRT5P43607 GEA1YJR031C 4227 nt2.29□□□□□ -2.04
RRT5P43607 GCV2YMR189W 3105 nt2.28□□□□□ -2.04
RRT5P43607 YDR209CYDR209C 414 nt2.28□□□□□ -2.04
RRT5P43607 YER135CYER135C 393 nt2.28□□□□□ -2.04
RRT5P43607 Q0142Q0142 177 nt2.28□□□□□ -2.04
RRT5P43607 YLR334CYLR334C 381 nt2.28□□□□□ -2.04
RRT5P43607 RPS7BYNL096C 573 nt2.28□□□□□ -2.04
RRT5P43607 YOL134CYOL134C 390 nt2.28□□□□□ -2.04
RRT5P43607 YOR248WYOR248W 303 nt2.28□□□□□ -2.04
RRT5P43607 YBR032WYBR032W 303 nt2.28□□□□□ -2.04
RRT5P43607 MSS18YPR134W 807 nt2.28□□□□□ -2.04
RRT5P43607 TPS2YDR074W 2691 nt2.28□□□□□ -2.04
RRT5P43607 YBT1YLL048C 4986 nt2.28□□□□□ -2.05
RRT5P43607 SSE1YPL106C 2082 nt2.27□□□□□ -2.05
RRT5P43607 SPF1YEL031W 3648 nt2.27□□□□□ -2.05
RRT5P43607 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt2.27□□□□□ -2.05
RRT5P43607 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt2.27□□□□□ -2.05
RRT5P43607 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt2.27□□□□□ -2.05
RRT5P43607 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt2.27□□□□□ -2.05
RRT5P43607 GPI8YDR331W 1236 nt2.27□□□□□ -2.05
RRT5P43607 GPI19YDR437W 423 nt2.27□□□□□ -2.05
RRT5P43607 HPA3YEL066W 540 nt2.27□□□□□ -2.05
RRT5P43607 RPS24AYER074W 408 nt2.27□□□□□ -2.05
RRT5P43607 PEX4YGR133W 552 nt2.27□□□□□ -2.05
RRT5P43607 YBL108WYBL108W 306 nt2.27□□□□□ -2.05
RRT5P43607 RPL25YOL127W 429 nt2.27□□□□□ -2.05
RRT5P43607 LEE1YPL054W 906 nt2.27□□□□□ -2.05
RRT5P43607 TRM7YBR061C 933 nt2.27□□□□□ -2.05
RRT5P43607 YPL261CYPL261C 309 nt2.27□□□□□ -2.05
RRT5P43607 YPR012WYPR012W 255 nt2.27□□□□□ -2.05
RRT5P43607 DNF1YER166W 4716 nt2.27□□□□□ -2.05
RRT5P43607 INO80YGL150C 4470 nt2.27□□□□□ -2.05
RRT5P43607 SUL1YBR294W 2580 nt2.27□□□□□ -2.05
RRT5P43607 YIL080WYIL080W 4722 nt2.27□□□□□ -2.05
RRT5P43607 YGL165CYGL165C 579 nt2.26□□□□□ -2.05
RRT5P43607 RPC10YHR143W-A 213 nt2.26□□□□□ -2.05
RRT5P43607 HYR1YIR037W 492 nt2.26□□□□□ -2.05
RRT5P43607 TIM8YJR135W-A 264 nt2.26□□□□□ -2.05
RRT5P43607 KTI11YBL071W-A 249 nt2.26□□□□□ -2.05
RRT5P43607 GCN4YEL009C 846 nt2.25□□□□□ -2.05
RRT5P43607 NOP19YGR251W 591 nt2.25□□□□□ -2.05
RRT5P43607 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt2.25□□□□□ -2.05
RRT5P43607 NFU1YKL040C 771 nt2.25□□□□□ -2.05
RRT5P43607 YML084WYML084W 309 nt2.25□□□□□ -2.05
RRT5P43607 RGM1YMR182C 636 nt2.25□□□□□ -2.05
RRT5P43607 YOR392WYOR392W 444 nt2.25□□□□□ -2.05
RRT5P43607 SLM6YBR266C 453 nt2.25□□□□□ -2.05
RRT5P43607 SIN3YOL004W 4611 nt2.25□□□□□ -2.05
RRT5P43607 FIR1YER032W 2631 nt2.25□□□□□ -2.05
RRT5P43607 NPR3YHL023C 3441 nt2.24□□□□□ -2.05
RRT5P43607 ECM25YJL201W 1800 nt2.24□□□□□ -2.05
RRT5P43607 UTP14YML093W 2700 nt2.24□□□□□ -2.05
RRT5P43607 PSO2YMR137C 1986 nt2.24□□□□□ -2.05
RRT5P43607 YDR269CYDR269C 324 nt2.24□□□□□ -2.05
RRT5P43607 CRG1YHR209W 876 nt2.24□□□□□ -2.05
RRT5P43607 AYR1YIL124W 894 nt2.24□□□□□ -2.05
RRT5P43607 YBR197CYBR197C 654 nt2.24□□□□□ -2.05
RRT5P43607 UTP22YGR090W 3714 nt2.24□□□□□ -2.05
RRT5P43607 SNX41YDR425W 1878 nt2.24□□□□□ -2.05
RRT5P43607 RRP12YPL012W 3687 nt2.23□□□□□ -2.05
RRT5P43607 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2.23□□□□□ -2.05
RRT5P43607 GIM4YEL003W 336 nt2.23□□□□□ -2.05
RRT5P43607 CAJ1YER048C 1176 nt2.23□□□□□ -2.05
RRT5P43607 YER087C-AYER087C-A 552 nt2.23□□□□□ -2.05
RRT5P43607 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt2.23□□□□□ -2.05
RRT5P43607 TEN1YLR010C 483 nt2.23□□□□□ -2.05
RRT5P43607 YAR068WYAR068W 486 nt2.23□□□□□ -2.05
RRT5P43607 YOL159CYOL159C 516 nt2.23□□□□□ -2.05
RRT5P43607 ATP15YPL271W 189 nt2.23□□□□□ -2.05
RRT5P43607 NIC96YFR002W 2520 nt2.23□□□□□ -2.05
RRT5P43607 KSP1YHR082C 3090 nt2.23□□□□□ -2.05
RRT5P43607 NUP170YBL079W 4509 nt2.23□□□□□ -2.05
RRT5P43607 ALK2YBL009W 2031 nt2.22□□□□□ -2.05
RRT5P43607 BRO1YPL084W 2535 nt2.22□□□□□ -2.05
RRT5P43607 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt2.22□□□□□ -2.05
RRT5P43607 YER079WYER079W 633 nt2.22□□□□□ -2.05
RRT5P43607 YGR025WYGR025W 303 nt2.22□□□□□ -2.05
RRT5P43607 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt2.22□□□□□ -2.05
RRT5P43607 ATP7YKL016C 525 nt2.22□□□□□ -2.05
RRT5P43607 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.22□□□□□ -2.05
RRT5P43607 MRPL33YMR286W 261 nt2.22□□□□□ -2.05
RRT5P43607 FPR1YNL135C 345 nt2.22□□□□□ -2.05
RRT5P43607 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt2.22□□□□□ -2.05
RRT5P43607 YPR039WYPR039W 336 nt2.22□□□□□ -2.05
RRT5P43607 MGR1YCL044C 1254 nt2.22□□□□□ -2.05
RRT5P43607 SWF1YDR126W 1011 nt2.21□□□□□ -2.06
RRT5P43607 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.21□□□□□ -2.06
RRT5P43607 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt2.21□□□□□ -2.06
RRT5P43607 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.21□□□□□ -2.06
RRT5P43607 RAM2YKL019W 951 nt2.21□□□□□ -2.06
RRT5P43607 YPK1YKL126W 2043 nt2.21□□□□□ -2.06
RRT5P43607 IRC19YLL033W 693 nt2.21□□□□□ -2.06
RRT5P43607 YOR105WYOR105W 327 nt2.21□□□□□ -2.06
RRT5P43607 snR13snR13 124 nt2.21□□□□□ -2.06
RRT5P43607 YPR089WYPR089W 2667 nt2.21□□□□□ -2.06
RRT5P43607 SAP185YJL098W 3177 nt2.2□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26 ms