Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NR4A2P43354 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR4A2P43354 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR4A2P43354 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR4A2P43354 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR4A2P43354 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR4A2P43354 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR4A2P43354 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR4A2P43354 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR4A2P43354 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR4A2P43354 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR4A2P43354 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR4A2P43354 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR4A2P43354 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR4A2P43354 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR4A2P43354 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR4A2P43354 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR4A2P43354 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR4A2P43354 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR4A2P43354 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR4A2P43354 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR4A2P43354 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms