Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC1A4P43007 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms