Protein–RNA interactions for Protein: P42704

LRPPRC, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRCP42704 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
LRPPRCP42704 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
LRPPRCP42704 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRPPRCP42704 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRPPRCP42704 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRPPRCP42704 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRPPRCP42704 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRPPRCP42704 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRPPRCP42704 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRPPRCP42704 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRPPRCP42704 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRPPRCP42704 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
LRPPRCP42704 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms