Protein–RNA interactions for Protein: P40558

CFD1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor CFD1, yeastyeast

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CFD1P40558 PAU1YJL223C 363 nt2.63□□□□□ -1.99
CFD1P40558 TMA10YLR327C 261 nt2.63□□□□□ -1.99
CFD1P40558 snR191snR191 274 nt2.63□□□□□ -1.99
CFD1P40558 CHS2YBR038W 2892 nt2.63□□□□□ -1.99
CFD1P40558 PUF6YDR496C 1971 nt2.63□□□□□ -1.99
CFD1P40558 YHR078WYHR078W 1659 nt2.63□□□□□ -1.99
CFD1P40558 PMR1YGL167C 2853 nt2.63□□□□□ -1.99
CFD1P40558 DYN1YKR054C 12279 nt2.62□□□□□ -1.99
CFD1P40558 UBP14YBR058C 2346 nt2.62□□□□□ -1.99
CFD1P40558 YDR209CYDR209C 414 nt2.62□□□□□ -1.99
CFD1P40558 CAJ1YER048C 1176 nt2.62□□□□□ -1.99
CFD1P40558 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.62□□□□□ -1.99
CFD1P40558 AIM32YML050W 936 nt2.62□□□□□ -1.99
CFD1P40558 YMR320WYMR320W 306 nt2.62□□□□□ -1.99
CFD1P40558 PGA1YNL158W 597 nt2.62□□□□□ -1.99
CFD1P40558 YNL034WYNL034W 1839 nt2.62□□□□□ -1.99
CFD1P40558 SAP1YER047C 2694 nt2.62□□□□□ -1.99
CFD1P40558 MSH2YOL090W 2895 nt2.62□□□□□ -1.99
CFD1P40558 YLR278CYLR278C 4026 nt2.61□□□□□ -1.99
CFD1P40558 COX1Q0045 1605 nt2.61□□□□□ -1.99
CFD1P40558 DRS2YAL026C 4068 nt2.61□□□□□ -1.99
CFD1P40558 RPS23AYGR118W 438 nt2.61□□□□□ -1.99
CFD1P40558 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt2.61□□□□□ -1.99
CFD1P40558 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.61□□□□□ -1.99
CFD1P40558 MMS1YPR164W 4224 nt2.6□□□□□ -1.99
CFD1P40558 TFB1YDR311W 1929 nt2.6□□□□□ -1.99
CFD1P40558 CHS3YBR023C 3498 nt2.6□□□□□ -1.99
CFD1P40558 STE5YDR103W 2754 nt2.6□□□□□ -1.99
CFD1P40558 GCN4YEL009C 846 nt2.6□□□□□ -1.99
CFD1P40558 NFT1YKR103W 3657 nt2.6□□□□□ -1.99
CFD1P40558 SPP382YLR424W 2127 nt2.6□□□□□ -1.99
CFD1P40558 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt2.6□□□□□ -1.99
CFD1P40558 SSY1YDR160W 2559 nt2.59□□□□□ -1.99
CFD1P40558 YER023C-AYER023C-A 213 nt2.59□□□□□ -1.99
CFD1P40558 YFR056CYFR056C 369 nt2.59□□□□□ -1.99
CFD1P40558 HOP2YGL033W 657 nt2.59□□□□□ -1.99
CFD1P40558 MCM22YJR135C 720 nt2.59□□□□□ -1.99
CFD1P40558 SHE2YKL130C 741 nt2.59□□□□□ -1.99
CFD1P40558 YLR031WYLR031W 561 nt2.59□□□□□ -1.99
CFD1P40558 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt2.59□□□□□ -1.99
CFD1P40558 IRC23YOR044W 474 nt2.59□□□□□ -1.99
CFD1P40558 SWD3YBR175W 948 nt2.59□□□□□ -1.99
CFD1P40558 ESL1YIL151C 3357 nt2.59□□□□□ -2
CFD1P40558 FLO11YIR019C 4104 nt2.59□□□□□ -2
CFD1P40558 YBT1YLL048C 4986 nt2.59□□□□□ -2
CFD1P40558 SIP3YNL257C 3690 nt2.58□□□□□ -2
CFD1P40558 TPS2YDR074W 2691 nt2.58□□□□□ -2
CFD1P40558 GCD6YDR211W 2139 nt2.58□□□□□ -2
CFD1P40558 NCE101YJL205C 162 nt2.58□□□□□ -2
CFD1P40558 RPL26AYLR344W 384 nt2.58□□□□□ -2
CFD1P40558 RPL33AYPL143W 324 nt2.58□□□□□ -2
CFD1P40558 snR43snR43 209 nt2.58□□□□□ -2
CFD1P40558 MYO5YMR109W 3660 nt2.58□□□□□ -2
CFD1P40558 PCF11YDR228C 1881 nt2.58□□□□□ -2
CFD1P40558 NPR1YNL183C 2373 nt2.58□□□□□ -2
CFD1P40558 DNA2YHR164C 4569 nt2.58□□□□□ -2
CFD1P40558 SKT5YBL061C 2091 nt2.57□□□□□ -2
CFD1P40558 HFM1YGL251C 3564 nt2.57□□□□□ -2
CFD1P40558 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.57□□□□□ -2
CFD1P40558 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt2.57□□□□□ -2
CFD1P40558 ECM5YMR176W 4236 nt2.57□□□□□ -2
CFD1P40558 REG1YDR028C 3045 nt2.57□□□□□ -2
CFD1P40558 MOT1YPL082C 5604 nt2.56□□□□□ -2
CFD1P40558 VPS52YDR484W 1926 nt2.56□□□□□ -2
CFD1P40558 YBP1YBR216C 2025 nt2.56□□□□□ -2
CFD1P40558 NUP82YJL061W 2142 nt2.56□□□□□ -2
CFD1P40558 GYP7YDL234C 2241 nt2.56□□□□□ -2
CFD1P40558 WIP1YDR374W-A 270 nt2.55□□□□□ -2
CFD1P40558 SMC2YFR031C 3513 nt2.55□□□□□ -2
CFD1P40558 YIL058WYIL058W 285 nt2.55□□□□□ -2
CFD1P40558 RPL39YJL189W 156 nt2.55□□□□□ -2
CFD1P40558 YPK1YKL126W 2043 nt2.55□□□□□ -2
CFD1P40558 RPL9BYNL067W 576 nt2.55□□□□□ -2
CFD1P40558 YBL073WYBL073W 312 nt2.55□□□□□ -2
CFD1P40558 DIA2YOR080W 2199 nt2.55□□□□□ -2
CFD1P40558 LCL1YPL056C 306 nt2.55□□□□□ -2
CFD1P40558 ATG13YPR185W 2217 nt2.55□□□□□ -2
CFD1P40558 MSB2YGR014W 3921 nt2.55□□□□□ -2
CFD1P40558 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.55□□□□□ -2
CFD1P40558 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.55□□□□□ -2
CFD1P40558 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.55□□□□□ -2
CFD1P40558 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.55□□□□□ -2
CFD1P40558 YER138CYER138C 5268 nt2.55□□□□□ -2
CFD1P40558 YER160CYER160C 5268 nt2.55□□□□□ -2
CFD1P40558 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.55□□□□□ -2
CFD1P40558 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.55□□□□□ -2
CFD1P40558 YJR027WYJR027W 5268 nt2.55□□□□□ -2
CFD1P40558 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.55□□□□□ -2
CFD1P40558 YML039WYML039W 5268 nt2.55□□□□□ -2
CFD1P40558 YML045WYML045W 5268 nt2.55□□□□□ -2
CFD1P40558 YMR050CYMR050C 5268 nt2.55□□□□□ -2
CFD1P40558 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.55□□□□□ -2
CFD1P40558 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.55□□□□□ -2
CFD1P40558 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.55□□□□□ -2
CFD1P40558 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.55□□□□□ -2
CFD1P40558 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.55□□□□□ -2
CFD1P40558 COG3YER157W 2406 nt2.54□□□□□ -2
CFD1P40558 MDV1YJL112W 2145 nt2.54□□□□□ -2
CFD1P40558 YJL016WYJL016W 1686 nt2.54□□□□□ -2
CFD1P40558 VPS3YDR495C 3036 nt2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.3 ms