Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK1P39086 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK1P39086 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms