Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ITGAEP38570 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms