Protein–RNA interactions for Protein: P38358

VBA2, Vacuolar basic amino acid transporter 2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VBA2P38358 CCW14YLR390W-A 717 nt2.59□□□□□ -1.99
VBA2P38358 YLR458WYLR458W 381 nt2.59□□□□□ -1.99
VBA2P38358 VTI1YMR197C 654 nt2.59□□□□□ -1.99
VBA2P38358 RPL33AYPL143W 324 nt2.59□□□□□ -1.99
VBA2P38358 ILS1YBL076C 3219 nt2.59□□□□□ -1.99
VBA2P38358 ASG1YIL130W 2895 nt2.59□□□□□ -2
VBA2P38358 YJR003CYJR003C 1560 nt2.58□□□□□ -2
VBA2P38358 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.58□□□□□ -2
VBA2P38358 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.58□□□□□ -2
VBA2P38358 PRP8YHR165C 7242 nt2.58□□□□□ -2
VBA2P38358 PRE8YML092C 753 nt2.58□□□□□ -2
VBA2P38358 YML099W-AYML099W-A 330 nt2.58□□□□□ -2
VBA2P38358 ATG13YPR185W 2217 nt2.58□□□□□ -2
VBA2P38358 SLH1YGR271W 5904 nt2.57□□□□□ -2
VBA2P38358 KAP104YBR017C 2757 nt2.57□□□□□ -2
VBA2P38358 MMS1YPR164W 4224 nt2.57□□□□□ -2
VBA2P38358 DYN2YDR424C 279 nt2.57□□□□□ -2
VBA2P38358 RPL40AYIL148W 387 nt2.57□□□□□ -2
VBA2P38358 RAM2YKL019W 951 nt2.57□□□□□ -2
VBA2P38358 YKR033CYKR033C 426 nt2.57□□□□□ -2
VBA2P38358 LCL2YLR104W 396 nt2.57□□□□□ -2
VBA2P38358 RGM1YMR182C 636 nt2.57□□□□□ -2
VBA2P38358 COQ10YOL008W 624 nt2.57□□□□□ -2
VBA2P38358 YME2YMR302C 2553 nt2.57□□□□□ -2
VBA2P38358 IRC10YOL015W 1761 nt2.56□□□□□ -2
VBA2P38358 DNL4YOR005C 2835 nt2.56□□□□□ -2
VBA2P38358 snR76snR76 109 nt2.56□□□□□ -2
VBA2P38358 YER023C-AYER023C-A 213 nt2.56□□□□□ -2
VBA2P38358 ABM1YJR108W 372 nt2.56□□□□□ -2
VBA2P38358 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt2.56□□□□□ -2
VBA2P38358 TFC4YGR047C 3078 nt2.56□□□□□ -2
VBA2P38358 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.56□□□□□ -2
VBA2P38358 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.56□□□□□ -2
VBA2P38358 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.56□□□□□ -2
VBA2P38358 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.56□□□□□ -2
VBA2P38358 YER138CYER138C 5268 nt2.56□□□□□ -2
VBA2P38358 YER160CYER160C 5268 nt2.56□□□□□ -2
VBA2P38358 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.56□□□□□ -2
VBA2P38358 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.56□□□□□ -2
VBA2P38358 YJR027WYJR027W 5268 nt2.56□□□□□ -2
VBA2P38358 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.56□□□□□ -2
VBA2P38358 YML039WYML039W 5268 nt2.56□□□□□ -2
VBA2P38358 YML045WYML045W 5268 nt2.56□□□□□ -2
VBA2P38358 YMR050CYMR050C 5268 nt2.56□□□□□ -2
VBA2P38358 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.56□□□□□ -2
VBA2P38358 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.56□□□□□ -2
VBA2P38358 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.56□□□□□ -2
VBA2P38358 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.56□□□□□ -2
VBA2P38358 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.56□□□□□ -2
VBA2P38358 TAO3YIL129C 7131 nt2.56□□□□□ -2
VBA2P38358 BAS1YKR099W 2436 nt2.56□□□□□ -2
VBA2P38358 snR79snR79 84 nt2.55□□□□□ -2
VBA2P38358 PAU14YIL176C 363 nt2.55□□□□□ -2
VBA2P38358 PAU1YJL223C 363 nt2.55□□□□□ -2
VBA2P38358 MSS11YMR164C 2277 nt2.55□□□□□ -2
VBA2P38358 RPL20AYMR242C 519 nt2.55□□□□□ -2
VBA2P38358 YAF9YNL107W 681 nt2.55□□□□□ -2
VBA2P38358 YBR197CYBR197C 654 nt2.55□□□□□ -2
VBA2P38358 ECM21YBL101C 3354 nt2.55□□□□□ -2
VBA2P38358 DBP10YDL031W 2988 nt2.55□□□□□ -2
VBA2P38358 RAX2YLR084C 3663 nt2.54□□□□□ -2
VBA2P38358 CDC50YCR094W 1176 nt2.54□□□□□ -2
VBA2P38358 RPL23BYER117W 414 nt2.54□□□□□ -2
VBA2P38358 TMA22YJR014W 597 nt2.54□□□□□ -2
VBA2P38358 YKL118WYKL118W 312 nt2.54□□□□□ -2
VBA2P38358 ATP3YBR039W 936 nt2.54□□□□□ -2
VBA2P38358 YPL216WYPL216W 3309 nt2.53□□□□□ -2
VBA2P38358 APC9YLR102C 798 nt2.53□□□□□ -2
VBA2P38358 CDC24YAL041W 2565 nt2.52□□□□□ -2.01
VBA2P38358 YER181CYER181C 324 nt2.52□□□□□ -2.01
VBA2P38358 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.52□□□□□ -2.01
VBA2P38358 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt2.52□□□□□ -2.01
VBA2P38358 AYR1YIL124W 894 nt2.52□□□□□ -2.01
VBA2P38358 RPS18BYML026C 441 nt2.52□□□□□ -2.01
VBA2P38358 YMR324CYMR324C 243 nt2.52□□□□□ -2.01
VBA2P38358 YBT1YLL048C 4986 nt2.52□□□□□ -2.01
VBA2P38358 YLR278CYLR278C 4026 nt2.51□□□□□ -2.01
VBA2P38358 DUG2YBR281C 2637 nt2.51□□□□□ -2.01
VBA2P38358 NHP2YDL208W 471 nt2.51□□□□□ -2.01
VBA2P38358 MSL1YIR009W 336 nt2.51□□□□□ -2.01
VBA2P38358 YAR053WYAR053W 297 nt2.51□□□□□ -2.01
VBA2P38358 RPL9BYNL067W 576 nt2.51□□□□□ -2.01
VBA2P38358 BIL1YOR304C-A 231 nt2.51□□□□□ -2.01
VBA2P38358 YGR067CYGR067C 2415 nt2.51□□□□□ -2.01
VBA2P38358 DBP7YKR024C 2229 nt2.5□□□□□ -2.01
VBA2P38358 TCB2YNL087W 3537 nt2.5□□□□□ -2.01
VBA2P38358 YDR193WYDR193W 399 nt2.5□□□□□ -2.01
VBA2P38358 HMF1YER057C 390 nt2.5□□□□□ -2.01
VBA2P38358 YHL037CYHL037C 402 nt2.5□□□□□ -2.01
VBA2P38358 YLR012CYLR012C 300 nt2.5□□□□□ -2.01
VBA2P38358 FPR1YNL135C 345 nt2.5□□□□□ -2.01
VBA2P38358 ROX1YPR065W 1107 nt2.5□□□□□ -2.01
VBA2P38358 ORC1YML065W 2745 nt2.5□□□□□ -2.01
VBA2P38358 ESL1YIL151C 3357 nt2.5□□□□□ -2.01
VBA2P38358 INP52YNL106C 3552 nt2.5□□□□□ -2.01
VBA2P38358 BCK1YJL095W 4437 nt2.49□□□□□ -2.01
VBA2P38358 YDL152WYDL152W 366 nt2.49□□□□□ -2.01
VBA2P38358 MZM1YDR493W 372 nt2.49□□□□□ -2.01
VBA2P38358 ERP6YGL002W 651 nt2.49□□□□□ -2.01
VBA2P38358 LSO2YGR169C-A 279 nt2.49□□□□□ -2.01
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