Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FDFT1P37268 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FDFT1P37268 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123 ms