Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR1P36897 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms