Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPB2P35606 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPB2P35606 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COPB2P35606 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPB2P35606 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPB2P35606 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COPB2P35606 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COPB2P35606 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPB2P35606 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPB2P35606 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPB2P35606 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPB2P35606 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPB2P35606 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPB2P35606 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPB2P35606 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPB2P35606 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPB2P35606 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPB2P35606 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPB2P35606 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPB2P35606 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPB2P35606 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPB2P35606 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COPB2P35606 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPB2P35606 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPB2P35606 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COPB2P35606 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPB2P35606 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPB2P35606 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPB2P35606 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPB2P35606 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPB2P35606 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPB2P35606 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COPB2P35606 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COPB2P35606 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COPB2P35606 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPB2P35606 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPB2P35606 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPB2P35606 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
COPB2P35606 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPB2P35606 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPB2P35606 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPB2P35606 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPB2P35606 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPB2P35606 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPB2P35606 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPB2P35606 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPB2P35606 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPB2P35606 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPB2P35606 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPB2P35606 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPB2P35606 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPB2P35606 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPB2P35606 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPB2P35606 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPB2P35606 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPB2P35606 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPB2P35606 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPB2P35606 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPB2P35606 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPB2P35606 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPB2P35606 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPB2P35606 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPB2P35606 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPB2P35606 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPB2P35606 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPB2P35606 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPB2P35606 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPB2P35606 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPB2P35606 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPB2P35606 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPB2P35606 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPB2P35606 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPB2P35606 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPB2P35606 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPB2P35606 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPB2P35606 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPB2P35606 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPB2P35606 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPB2P35606 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPB2P35606 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPB2P35606 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPB2P35606 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPB2P35606 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPB2P35606 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPB2P35606 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPB2P35606 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPB2P35606 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPB2P35606 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPB2P35606 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPB2P35606 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPB2P35606 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPB2P35606 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPB2P35606 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPB2P35606 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPB2P35606 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPB2P35606 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPB2P35606 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
COPB2P35606 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPB2P35606 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPB2P35606 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms