Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJA4P35212 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJA4P35212 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJA4P35212 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJA4P35212 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJA4P35212 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJA4P35212 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJA4P35212 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GJA4P35212 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA4P35212 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA4P35212 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA4P35212 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA4P35212 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA4P35212 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA4P35212 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA4P35212 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA4P35212 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA4P35212 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA4P35212 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA4P35212 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA4P35212 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA4P35212 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA4P35212 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA4P35212 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA4P35212 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA4P35212 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA4P35212 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA4P35212 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA4P35212 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GJA4P35212 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA4P35212 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA4P35212 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA4P35212 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA4P35212 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA4P35212 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA4P35212 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA4P35212 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA4P35212 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA4P35212 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA4P35212 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA4P35212 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA4P35212 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA4P35212 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA4P35212 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA4P35212 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA4P35212 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA4P35212 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA4P35212 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA4P35212 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA4P35212 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA4P35212 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJA4P35212 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJA4P35212 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJA4P35212 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJA4P35212 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJA4P35212 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJA4P35212 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJA4P35212 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJA4P35212 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJA4P35212 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJA4P35212 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJA4P35212 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJA4P35212 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GJA4P35212 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJA4P35212 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJA4P35212 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJA4P35212 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJA4P35212 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJA4P35212 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJA4P35212 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJA4P35212 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GJA4P35212 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJA4P35212 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJA4P35212 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJA4P35212 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJA4P35212 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJA4P35212 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJA4P35212 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJA4P35212 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJA4P35212 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJA4P35212 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJA4P35212 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJA4P35212 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJA4P35212 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJA4P35212 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJA4P35212 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJA4P35212 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJA4P35212 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJA4P35212 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJA4P35212 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJA4P35212 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJA4P35212 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJA4P35212 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJA4P35212 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJA4P35212 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJA4P35212 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJA4P35212 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJA4P35212 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJA4P35212 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJA4P35212 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms