Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM5P33992 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM5P33992 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM5P33992 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM5P33992 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM5P33992 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM5P33992 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM5P33992 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM5P33992 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM5P33992 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM5P33992 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM5P33992 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM5P33992 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM5P33992 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM5P33992 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM5P33992 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM5P33992 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM5P33992 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM5P33992 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM5P33992 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM5P33992 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM5P33992 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM5P33992 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM5P33992 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM5P33992 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM5P33992 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM5P33992 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM5P33992 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM5P33992 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM5P33992 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM5P33992 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM5P33992 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM5P33992 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM5P33992 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM5P33992 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM5P33992 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM5P33992 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM5P33992 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM5P33992 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM5P33992 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM5P33992 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM5P33992 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM5P33992 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM5P33992 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM5P33992 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM5P33992 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM5P33992 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM5P33992 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM5P33992 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM5P33992 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM5P33992 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM5P33992 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM5P33992 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM5P33992 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM5P33992 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM5P33992 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM5P33992 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM5P33992 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM5P33992 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM5P33992 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM5P33992 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM5P33992 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM5P33992 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM5P33992 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM5P33992 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM5P33992 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM5P33992 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM5P33992 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM5P33992 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM5P33992 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM5P33992 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM5P33992 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM5P33992 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM5P33992 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM5P33992 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM5P33992 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM5P33992 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM5P33992 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM5P33992 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM5P33992 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM5P33992 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM5P33992 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM5P33992 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM5P33992 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM5P33992 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM5P33992 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM5P33992 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM5P33992 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM5P33992 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM5P33992 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM5P33992 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM5P33992 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM5P33992 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM5P33992 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM5P33992 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MCM5P33992 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCM5P33992 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCM5P33992 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCM5P33992 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCM5P33992 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms