Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms