Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA13P31271 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms