Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPOP30536 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPOP30536 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPOP30536 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPOP30536 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPOP30536 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPOP30536 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPOP30536 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPOP30536 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPOP30536 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPOP30536 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPOP30536 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPOP30536 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPOP30536 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPOP30536 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPOP30536 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPOP30536 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPOP30536 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPOP30536 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPOP30536 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPOP30536 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPOP30536 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPOP30536 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPOP30536 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPOP30536 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPOP30536 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPOP30536 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPOP30536 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPOP30536 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPOP30536 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPOP30536 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPOP30536 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPOP30536 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPOP30536 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPOP30536 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPOP30536 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPOP30536 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPOP30536 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPOP30536 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPOP30536 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPOP30536 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPOP30536 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPOP30536 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPOP30536 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPOP30536 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPOP30536 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPOP30536 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPOP30536 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPOP30536 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPOP30536 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPOP30536 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPOP30536 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPOP30536 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPOP30536 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPOP30536 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPOP30536 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPOP30536 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPOP30536 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPOP30536 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPOP30536 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPOP30536 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPOP30536 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPOP30536 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPOP30536 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPOP30536 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPOP30536 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPOP30536 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPOP30536 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPOP30536 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPOP30536 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPOP30536 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPOP30536 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPOP30536 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPOP30536 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPOP30536 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPOP30536 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPOP30536 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPOP30536 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPOP30536 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPOP30536 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPOP30536 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPOP30536 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPOP30536 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPOP30536 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPOP30536 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPOP30536 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPOP30536 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPOP30536 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPOP30536 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPOP30536 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPOP30536 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPOP30536 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPOP30536 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPOP30536 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPOP30536 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPOP30536 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPOP30536 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPOP30536 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPOP30536 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPOP30536 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms