Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA1P29973 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms